بنیادکودک اولین مؤسسه خیریه ایرانی است که موفق به دریافت مجوز فعالیت ملی شده است. بنابر این مجوز، بنیادکودک مجاز است تا در سطح ملی و در تمامی استان های کشور و نیز در سطح بین الملل دفتر نمایندگی داشته باشد. آخرین مجوز ملی فعالیت بنیادکودک به شماره 181099 به تاریخ 1403/10/20 از سوی وزارت کشور به مدت چهار سال تمدید شده است.